L’unité « Omiques et Data Science » (Omics Data Science Unit) est constituée par une équipe de recherche translationnelle intégrée au sein de la Direction Scientifique et de la Recherche Translationnelle de l’Institut de Cancérologie de l’Ouest (ICO) localisée à Nantes et Angers. L’unité est spécialisée dans les data sciences appliquées aux projets de recherche translationnelle et fondamentale en cancérologie, et travaille spécifiquement sur l'analyse de données omiques (transcriptomique, protéomique, génomique, radiomique…) en mode mono-omique et multi-omique. Nos travaux s’inscrivent dans le cadre du développement de la médecine de précision. L’unité regroupe toutes les compétences professionnelles nécessaires à leur bonne réalisation : expertise métier en biologie et oncologie, informatique et mathématique. Nous collaborons de façon étroite avec les laboratoires de mathématique de Nantes et d’Angers (LAREMA), et l’Ecole Centrale de Nantes. D’une manière générale, les analyses consistent à :
- déterminer des classes (sous-typage…) ;
- comparer des classes (biomarqueurs…) ;
- prédire l’appartenance à des classes (évolution de la maladie, réponse aux traitements…).
Pour ce faire, nous utilisons une batterie d’approches mathématiques, dont l’intelligence artificielle, le machine learning..., et différents langages informatiques. D’autre part, l’unité a créé et assure le développement continu de l’outil web bc-GenExMiner qui bénéficie d’une reconnaissance internationale.
